Gene RRNA16S, identificação por seqüenciamento parcial, cepa de microrganismo

Orientações aos clientes

• Este exame permite maior precisão na identificação de espécies bacterianas pouco reativas a provas bioquímicas convencionais.
• A amostra pode ser enviada em meio sólido ou em swab com meio de transporte.
• Os isolados de origem clínica devem conter especificação do material clínico, data da cultura e idade do cliente.
• Para a identificação de micobactérias, o Laboratório oferece exame específico.

Orientações necessárias

• Este exame permite maior precisão na identificação de espécies bacterianas pouco reativas a provas bioquímicas convencionais.
• A amostra pode ser enviada em meio sólido ou em swab com meio de transporte.
• Os isolados de origem clínica devem conter especificação do material clínico, data da cultura e idade do cliente.
• Para a identificação de micobactérias, o Fleury oferece exame específico.

Processamento e adequação da amostra

• A amostra pode ser enviada em meio sólido ou em swab com meio de transporte, em temperatura ambiente.
• Para os isolados de origem clínica, devem ser informados os seguintes dados: material clínico, data da cultura e idade do paciente.
• Temporariamente não serão aceitas amostras em meio líquido.
• Pode ser aceita mesmo se enviada refrigerada.

Método

• Seqüenciamento parcial do gene rRNA 16S.

Valor de referência

• Não aplicável.

Interpretação e comentários

• O método é útil na caracterização de espécies bacterianas pouco reativas a provas bioquímicas convencionais, assim como em situações nas quais a complexidade dos testes tradicionais necessários para a diferenciação de espécies torna sua execução inviável.
• O seqüenciamento tem a vantagem de gerar uma informação que pode ser armazenada e reavaliada em face de novas diretrizes taxonômicas. O tamanho mínimo do fragmento analisado é de 1.000 pares de bases e o ponto de corte utilizado para a identificação das espécies, de 99,5%.
• Na prática, o exame compara a seqüência obtida do gene rRNA 16S com as seqüências referentes a cepas de coleções de culturas, disponíveis no GenBank. A referência do depósito com maior índice de similaridade é incluída no resultado.